Ces activités de laboratoire, intégrées au Service des Maladies Infectieuses,  couvrent les domaines de la microbiologie médicale.

La microbiologie inclut différentes disciplines : la bactériologie, la sérologie, la biologie moléculaire,la parasitologie, la mycobactériologie et la mycologie. Ce secteur prend en charge tous les prélèvements pour la mise en évidence, l'identification et la susceptibilité aux agents anti-infectieux des micro-organismes.